基于真空飞轮储能器的不间断电源在原理上与传统的不间断电源没有大的差别，从逻辑上说只是用真空飞轮储能器替代了原有的化学电池。在实际的架构上，飞轮不间断电源在针对数据中心或通信中心的应用和针对工业的应用存在着一定的差别。

在数据中心或通信中心，市电经过整流器转变为直流，再通过逆变器转变为50Hz的交流供负载使用，化学电池或飞轮储能器的直流输出并联在不间断电源的直流端。

在工业应用中，对于多变频器生产环境，往往采用共直流母线的架构，在这种环境下，飞轮储能器通过驱动器并联在直流母线，飞轮的充电储能由驱动器控制，而飞轮的放电则是通过并联在驱动器IGBT上的续流二极管转变成直流溃入直流母线，这种应用无需配置逆变器。